《條例》共四十二條，分為總則、保護區(qū)的劃定、保護措施、法律責(zé)任和附則五章，主要規(guī)定了以下四個方面的內(nèi)容：

一、明確了保護管理體制

（一）規(guī)定了各級政府的職責(zé)

規(guī)定市、區(qū)（縣級市）人民政府負(fù)責(zé)本行政區(qū)域內(nèi)飲用水水源地保護工作，同時要求鎮(zhèn)政府、街道辦事處做好轄區(qū)內(nèi)飲用水水源地保護相關(guān)工作。

（二）明確了政府工作部門的職責(zé)

• 環(huán)境保護部門負(fù)責(zé)對飲用水水源地污染防治實施統(tǒng)一監(jiān)督管理；

• 水行政主管部門負(fù)責(zé)編制水功能區(qū)劃和飲用水水源工程的建設(shè)管理工作；

• 畜牧獸醫(yī)主管部門負(fù)責(zé)飲用水水源地畜禽養(yǎng)殖廢棄物綜合利用的指導(dǎo)和服務(wù)；

• 國土資源部門負(fù)責(zé)飲用水水源保護區(qū)建設(shè)項目用地和礦產(chǎn)資源開采審批以及土地利用的監(jiān)督管理工作；

• 農(nóng)業(yè)部門負(fù)責(zé)飲用水水源地農(nóng)業(yè)面源污染防治工作；

• 林業(yè)部門負(fù)責(zé)飲用水水源地水源涵養(yǎng)林、護岸林的規(guī)劃和建設(shè)管理以及退耕還林政策的制定工作；

• 發(fā)展改革、公安等其他有關(guān)部門按照各自職責(zé)協(xié)同做好飲用水水源地保護相關(guān)工作。

（三）提出了加強公眾參與的措施

一方面積極開展飲用水水源地保護的宣傳教育，另一方面設(shè)立舉報、獎勵制度，鼓勵廣大群眾積極參與到飲用水水源地保護工作中來。

二、明確了保護區(qū)的劃定程序

我市飲用水水源地保護實行保護區(qū)制度，劃分為一級保護區(qū)和二級保護區(qū)，并在保護區(qū)以外劃定準(zhǔn)保護區(qū)。

（一）明確了飲用水水源地的確定原則

規(guī)定根據(jù)本行政區(qū)域內(nèi)經(jīng)濟社會發(fā)展需要和水資源開發(fā)利用現(xiàn)狀，按照優(yōu)先保障居民生活飲用水的原則，統(tǒng)籌規(guī)劃確定飲用水水源地并向社會公布。

（二）確定了保護區(qū)劃定、調(diào)整的主體和程序

規(guī)定市、區(qū)（縣級市）政府依法劃定一定范圍的水域、陸域作為飲用水水源地保護區(qū)，報請省政府批準(zhǔn)后公布；需要調(diào)整或者取消的，按照原批準(zhǔn)程序重新報批。

三、細(xì)化了保護措施

《條例》對飲用水水源地保護堅持綜合治理、防治結(jié)合的原則。

針對“防”，做了以下制度設(shè)計：

• 規(guī)定在飲用水水源保護區(qū)邊界設(shè)立明顯的地理界標(biāo)和警示標(biāo)志，并在一級保護區(qū)重點地段設(shè)置隔離防護設(shè)施；

• 規(guī)定在一級、二級保護區(qū)和準(zhǔn)保護區(qū)的禁止性行為；

• 嚴(yán)禁運輸危險化學(xué)品、危險廢物等有毒有害物質(zhì)的車輛擅自駛?cè)腼嬘盟�水源保護區(qū)，確需駛?cè)氲模瑧?yīng)當(dāng)報經(jīng)公安機關(guān)批準(zhǔn)；

• 建立水源保護協(xié)管員隊伍，建立定期巡查制度，協(xié)助做好相關(guān)工作；

• 建立飲用水水源保護區(qū)周邊區(qū)域環(huán)境狀況和污染風(fēng)險調(diào)查評估制度，篩查可能存在的污染風(fēng)險因素，并采取相應(yīng)的風(fēng)險防范措施；

• 各有關(guān)部門、單位應(yīng)當(dāng)進行應(yīng)急能力建設(shè)，編制水污染事故應(yīng)急預(yù)案，儲備應(yīng)急物資，定期進行應(yīng)急演練。

針對“治”，做了以下制度設(shè)計：

• 規(guī)定飲用水水源一級保護區(qū)實行退耕還林，保護區(qū)內(nèi)居民應(yīng)當(dāng)實施搬遷；

• 二級保護區(qū)內(nèi)的畜禽養(yǎng)殖專業(yè)戶、散養(yǎng)戶應(yīng)當(dāng)采取必要的污染防治措施，妥善處理畜禽養(yǎng)殖廢棄物；

• 建立污染水源農(nóng)資產(chǎn)品的有償回收制度；

• 在保護區(qū)和準(zhǔn)保護區(qū)內(nèi)建設(shè)水源涵養(yǎng)林、護岸林，保持水土平衡；

• 做好水源地水質(zhì)監(jiān)測工作，并及時向社會公開水質(zhì)狀況信息；

• 建立健全生態(tài)補償機制等等。

四、關(guān)于法律責(zé)任

一方面，對政府及有關(guān)部門工作人員濫用職權(quán)、玩忽職守等行為，規(guī)定了相應(yīng)的行政處分措施。

另一方面，對行政管理相對人的違法行為，根據(jù)違法事實、情節(jié)輕重和社會危害程度，規(guī)定了相應(yīng)的行政處罰等措施。

• 對創(chuàng)設(shè)的禁止性行為規(guī)定了相應(yīng)處罰措施；

• 對上位法沒有明確監(jiān)管部門的非規(guī)模化畜禽養(yǎng)殖專業(yè)戶、散養(yǎng)戶，確定由環(huán)境保護部門進行處罰；

• 規(guī)定行政主管部門可以將飲用水水源地一級保護區(qū)水面的處罰權(quán)委托給符合條件的飲用水水源地管理機構(gòu)行使。